Oui il meurt pour de bon. En fait, l'équipe de terrosistes n'avait pas prévu que FoxDie tuerait Octopus. Il devait se déguiser en chef du DARPA pour faire marcher Snake dans leur plan.
PS: pour information, c'est Solid Snake qui transporte le virus FoxDie, sans même le savoir (c'est de cette manière qu'il était sensé tuer le chef du DARPA et Baker pour éviter qu'ils ne dévoilent leurs codes secrèts aux terrorsites).